二、体系建立
这个阶段主要是依据第·一阶段的准备情况和调研结果，制定ISO9001体系框架，并依据框架编写体系文件，并监督体系运行及持续改进。
2.1、ISO9001认证建立质量管理框架
依据第·一阶段的调研分析结果，结合ISO9001标准要求，制定质量管理框架。框架要从整体和全局的视角，从质量管理系统的所有层面进行整体建设，从质量管理体系本身出发，根据业务性质、组织特征、状况和技术条件，建立质量管理体系框架，进行现状分析、需求分析和质量控制，准备适用性声明等步骤，从而提出建设质量管理体系的解决方案。
2.2、ISO9001认证体系文件编写
依据2.1的框架，编写ISO9001质量管理体系文件，应该包含：质量手册、方针文档、质量目标文档、实施与控制文档、受控文件清单等。
文件的结构可以参考划分三级：一级包质量管理手册，方针，二级包括质量管理体系程序文件，三级是模板和清单。
2.3、ISO9001认证体系的运行与改进
质量管理体系文件编制完成后，应由文件管理部门申请评审，评审通过后予以发布。发布后的文件需在企业范围内落地实施。在公司范围内组织培训是保证实施效果的一个比较不错的方法。在质量管理体系运行的过程中，体系管理部门要对体系的运行情况进行内部审核，及时发现体系策划中存在的问题，找出问题根源，采取纠正措施，并按照更改控制程序要求对体系予以更改，以达到进一步完善质量管理体系的目的。
三、认证审核
当体系在企业范围内运行满6个月且进行内部审核后，就可以申请体系审核了，体系审核是为获得审核证据，对体系进行客观的评价，以确定满足审核准则的程度所进行的系统的、独立的并形成文件的检查过程。
体系审核包括内部审核和外部审核(第三方审核)，内部审核上面提到过，是以体系内部自查为主的审核。外部审核一般由CCAA认可的具有审核发证权利的第三方认证机构执行，可以提供符合要求的认证或注册，认证审核通过后，认证机构可以为企业颁发体系证书。
